公司印章管理不善可能引发一系列法律问题。一方面，可能导致印章被滥用，如他人擅自使用公司印章签订合同、对外担保等，使公司面临不必要的债务风险和法律纠纷。若公司无法证明印章使用并非公司真实意思表示，可能需对相关行为承担法律责任。另一方面，围绕印章控制权也可能产生纠纷，如股东之间、管理层之间因争夺印章控制权而引发冲突，影响公司正常运营。此外，印章保管不当还可能导致印章丢失、被盗用，进一步增加公司的风险隐患。​

案例：F 公司的一名员工王某，利用公司印章管理漏洞，私自加盖公司印章与 G 公司签订了一份借款合同，借款金额高达 500 万元。合同到期后，因王某无力偿还借款，G 公司将 F 公司告上法庭，要求 F 公司承担还款责任。F 公司辩称该借款合同并非公司真实意思表示，系王某私自加盖印章所为，但由于公司无法提供充分证据证明印章管理存在问题及借款合同与公司无关，最终法院判决 F 公司承担还款责任。​

法律分析：公司印章是公司对外进行活动的重要凭证，具有代表公司意志的法律效力。一般情况下，加盖公司印章的文件被视为公司的意思表示。根据相关法律规定，若公司不能证明印章系他人擅自使用且相对人知道或应当知道该情况，公司需对印章所产生的法律后果承担责任。在印章控制权纠纷方面，若因公司内部管理不善导致印章争夺等问题，可能影响公司正常决策和运营，违反公司章程及相关法律法规关于公司治理的规定。​

律师建议：公司应建立严格的印章管理制度，明确印章的保管、审批、使用流程和权限。指定专人负责印章保管，使用印章时必须经过严格的审批程序，并做好详细的使用登记记录。对于重要合同、文件等使用印章，应进行多环节审核，确保印章使用符合公司利益和决策程序。同时，要加强对员工的法律培训，提高员工对印章重要性的认识，防范内部人员滥用印章风险。若发现印章丢失或被盗用，应及时采取挂失、报警等措施，并通过合法途径声明相关印章使用行为无效，降低公司风险。​